虚拟筛选受体结构新算法便捷又便宜

科技日报讯 （雷鸣 周圆 记者马爱平）记者日前从广东医科大学得知，该校东莞科研中心副主任黄遵楠教授研究出靶向虚拟挑选卵白受体构造新的优选算法，可明显下降计算本钱，应用范围广，有希望成为挑选高质量卵白构造的标准办法。

如今，计算机帮助药物设计的虚拟挑选被大规模应用于活性化合物的发现，是创新药物研究的核心技术之一。靶向虚拟挑选的命中率很洪水平上取决于所用卵白构造质量。现有测试卵白构造好坏的经典计算办法是进行辨别配体和非配体能力的虚拟挑选。黄遵楠提出了一个新颖的卵白受体构造优选算法和其挑选性能指数（简称SPI）。该算法只通过测试卵白构造与活性配体两两间的互相对接，计算每个卵白构造SPI，即与其对接优越的配体（联合能优于整体平均联合能）占一切配体的比例。

“比起传统挑选办法，新算法计算更轻便、所需求求更少，并且应用范围更广。新算法只需求十多个活性配体的存在，而无需应用钓饵化合物数据库，同时该办法也可实用于从理论计算构造中来设计挑选高质量的受体构造，这是之前除经典办法外其他办法能干为力的地方。”黄遵楠说。